序【程 久美子】
巻頭ガイド【北條浩彦】
[ 第1部 RNAi研究を始める前に知っておきたいこと ]
1章 RNAiの基本メカニズムに関するQ&A
1.哺乳類でのRNAiのメカニズムを教えてください.【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
2.生物種によってどのように異なるのですか? 〜ショウジョウバエのRNAi【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
3.生物種によってどのように異なるのですか? 〜線虫のRNAi【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
4.生物種によってどのように異なるのですか? 〜酵母のRNAi【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
5.生物種によってどのように異なるのですか? 〜植物のRNAi【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
6.RISCとは何ですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
7.Dicerとは何ですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
8.Droshaとは何ですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
9.Argonauteファミリーとは何ですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
10.AGO(Argonaute)とeIF2Cは違うものですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
11.RNAiとknockout(KO)の違いは何ですか? どのように使い分ければよいですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
12.miRNAとsiRNAはどのように違うのですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
13.shRNAとは何ですか? またどうしてRNAiが誘導されるのですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
14.哺乳類細胞にRNAiを誘導する時,なぜ30 bp以上の長いdsRNAが使えないのですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
15.なぜ,3´末端が2塩基突出したsiRNAを使用するのですか? また,多くの実験で使用するsiRNAは,なぜ21〜23塩基なのですか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
16.内在性遺伝子をターゲットとするRNAi誘導実験の注意点を教えてください.【山田佳世子,芝本さゆみ,水谷隆之】
17.RNAiはどのくらい長く持続しますか?【石塚 明,塩見春彦,塩見美喜子】
2章 siRNAの基本的性質に関するQ&A
18.二本鎖siRNAと一本鎖のアンチセンス鎖siRNAでどのくらい発現抑制効果が違うのですか?【北條浩彦】
19.合成RNAを使ってsiRNA二量体(dsRNA)にする方法を教えてください.【北條浩彦】
20.siRNA二量体(dsRNA)をどのように確認・保存したら良いでしょうか?【北條浩彦】
21.修飾siRNAの種類とその長所・短所を教えてください.【北條浩彦】
[ 第2部 RNAi実験の準備に関すること ]
3章 RNAi実験に必要な材料・設備に関するQ&A
22.RNAi実験をはじめるために,何を準備したらよいですか? どのような器具や設備が必要なのですか?【芝本さゆみ,水谷隆之】
23.化学合成したsiRNAはどのように入手するのですか?【水谷隆之】
24.化学合成したsiRNA以外にsiRNAをつくる方法を教えてください.【山田佳世子,水谷隆之】
25.siRNAの取り扱いの注意点は何ですか?【芝本さゆみ,水谷隆之】
26.siRNAを発現するDNAベクターは自分でつくることができますか?【山田佳世子,水谷隆之】
4章 siRNAの配列選択に関するQ&A
27.使用するsiRNAの配列は,どのような配列でも良いのですか?【程 久美子】
28.siRNAの配列選択にはどのような方法がありますか? それぞれの特徴を教えてください.【程 久美子】
29.配列選択のウェブサイトにはどのようなものがあるのですか?【程 久美子】
30.オフターゲット効果とは何ですか? またオフターゲット効果を最少にする配列設計法はあるのですか?【程 久美子】
31.ショウジョウバエや線虫でも使用するsiRNAの配列は選択しなければならないのですか?.また, 長いdsRNAを使用する時の注意点は何ですか?【程 久美子】
[ 第3部 RNAiの誘導法 ]
5章 siRNAのトランスフェクションに関するQ&A
32.siRNAの細胞への導入方法を教えてください.【程 久美子】
33.各種トランスフェクション法の適用条件や,メリット・デメリットを教えてください.【程 久美子】
34.siRNAがトランスフェクションされた細胞だけを選択することはできますか?【程 久美子】
35.RNAi誘導後,どのくらいの時間でRNAi活性を観察できるようになりますか?【程 久美子】
36.発現ベクターを使ったRNAi誘導方法について,発現ベクターの種類とその特徴を教えてください.【程 久美子】
37.培養細胞の種類やsiRNAの配列によってトランスフェクション効率は変わるのですか?【程 久美子】
38.トランスフェクション効率の低い培養細胞の場合,何か他に良い方法はないでしょうか?【程 久美子】
39.トランスフェクションによるサイドエフェクトはあるのですか?【程 久美子】
6章 RNAi効果の評価法に関するQ&A
40.RNAi効果を判定するにはどのような方法があるのですか?【北條浩彦】
41.RNAi効果を簡単に評価する方法を教えてください.【北條浩彦】
内在性の遺伝子をターゲットとしてRNAiを誘導した時の評価方法を教えてください.【北條浩彦】
43.RNAiを評価する時の注意点を教えてください.【北條浩彦】
44.一般的に使われているレポーター遺伝子を使ったRNAiの評価方法を教えてください.その利用法も教えてください.【北條浩彦】
45.コントロールとして用いるsiRNAは何が良いですか?【北條浩彦】
46.RT-PCRやウエスタンブロット法で評価する場合の注意点を教えてください.【北條浩彦】
7章 RNAiライブラリに関するQ&A
47.siRNAライブラリとは何ですか? その特徴を教えてください.【山田佳世子,水谷隆之】
48.現在どのような種類のコレクションやライブラリがありますか? その利用法を教えてください.【山田佳世子,水谷隆之】
49.自分でライブラリを作ることはできますか?【山田佳世子,水谷隆之】
50.ライブラリを用いたスクリーニングの成功例を教えてください.【山田佳世子,水谷隆之】
[ 第4部 RNAiの応用に関すること ]
8章 siRNAのデリバリーに関するQ&A
51.個体やある特定の組織にsiRNAをデリバリーする方法はありますか?また,効率の良いsiRNAデリバリー方法を教えてください.【木藤健治,住本秀敏,河上 裕】
52.RNAiの誘導をコントロールすることは可能ですか?【木藤健治,住本秀敏,河上 裕】
53.in vivo実験,臨床応用可能なベクターにはどのようなものがありますか?【木藤健治,住本秀敏,河上 裕】
54.マウスの個体を使ったin vivo RNAi誘導法はどこまで開発されているのですか?【木藤健治,住本秀敏,河上 裕】
55.それぞれのウイルスベクターがどのような方法に向いているのか,どのような利点があるのか教えてください.【木藤健治,住本秀敏,河上 裕】
9章 RNAiの臨床応用に関するQ&A
56.インターフェロン応答(抗ウイルス反応)とは何ですか? また,インターフェロン応答を回避する方法を教えてください.【住本秀敏,河上 裕】
57.RNAiを医薬として応用する場合の問題点を教えてください.【住本秀敏,河上 裕】
58.生体への毒性はありますか?.【住本秀敏,河上 裕】
59.RNAiのヒトでの臨床応用例があれば教えてください.【住本秀敏,河上 裕】
60.対立遺伝子特異的なRNAi誘導は可能ですか?【住本秀敏,河上 裕】
61.それぞれの疾患によって,どの程度遺伝子を抑えるべきかという基準が異なっていると思います.疾患ごとに厳密に制御できるのですか?【住本秀敏,河上 裕】
62.RNAiによる治療は個人差があると考えられますか?【住本秀敏,河上 裕】
[付録]RNAiの理解に役立つ用語解説
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