羊土社:バイオサイエンスと医学の専門出版社
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実験プロトコール
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エピジェネティクス実験プロトコール
DNAメチル化とヒストン修飾を網羅的・領域特異的,定量的に解析する実験手法のすべて

この領域のメチル化状態は?この酵素のアセチル化活性は?より広い領域の修飾状態を調べるには?目的に応じた手法の選択から実験の原理・コツまで余さず解説.この1冊で実験開始からデータを得るまで迷うことなし!

エピジェネティクス実験プロトコール


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※本書の正誤表はこちらをご参照下さい.


ナビ編

序章 エピジェネティクス解析ナビ

1.エピジェネティクス解析の重要性【牛島俊和】
2.DNAメチル化解析ナビ【牛島俊和/服部奈緒子】
3.ヒストン化学修飾解析ナビ 【眞貝洋一】

実践編

1章 DNAメチル化解析

1.バイサルファイトシークエンシング【千葉初音/佐々木裕之】
2.MSPと定量的MSP 【丹羽 透/山下 聡/牛島俊和】
3.メチル化感受性制限酵素によるDNAメチル化検出【 ?井大哉】
4.COBRA法【鈴木 拓/豊田 実】
5.パイロシークエンス法?複数のCpGのメチル化を定量する【近藤 豊】
6.質量分析機(MassARRAYR)によるDNAメチル化定量解析【金田篤志】
7.DNAメチル化酵素の活性測定?放射性化合物を用いた活性測定【末武 勲/田嶋正二】
8.5-aza-dC処理(TSA処理含む)【山下 聡】
9.T-DMRメチル化レポーターアッセイ【佐藤 俊/塩田邦郎/田中 智】

2章 ヒストン化学修飾解析

1.ヒストン修飾抗体を用いたウエスタンブロット解析 【立花 誠】
2.クロマチン免疫沈降(ChIP)法【林 陽子/後藤友二/木村 宏】
3.HAT活性・HDAC活性測定 【伊藤昭博/前田里子/吉田 稔】
4.ヒストンメチル化活性測定【西岡憲一】
5.ヒストン脱メチル化活性測定?ウエスタンブロットおよび質量分析法【米沢理人/Andreas Schmidt】

3章 網羅的解析

1.メチル化DNA免疫沈降法(MeDIP法)?DNAメチル化領域を網羅的に検出する 【永江玄太/油谷浩幸】
2.DNAメチル化アレイ:MIAMI法【畑田出穂】
3.ChIP on chip法を用いた染色体構造の網羅的解析【坂東優篤/白髭克彦】
4.ChIP-Seq 【金井昭教/菅野純夫/鈴木 穣】

付録

1.汎用試薬リスト

2.ヒストン修飾制御マップ

実験医学別冊 注目のバイオ実験シリーズ

エピジェネティクス実験プロトコール

 

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