羊土社:バイオサイエンスと医学の専門出版社
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バイオ研究が10倍はかどる
MacOSX活用マニュアル
セットアップから超簡単データ解析まで

MacOSXはバイオ研究にとって,こんなに便利なものだった! 日々の研究に役立つ,100種類以上のツールが無償で使え,UNIXの能力を引きだせば煩雑な大量解析もあなたの机で可能になる! カラーの図解でイチから解説!

MacOSX活用マニュアル


内容見本1内容見本2内容見本3
内容見本
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序章 なぜ,今MacOSXをおすすめするのか

1章 MacOSXのセットアップ

1.セットアップの前にこれだけは知っておきたい基礎知識

2.ステップ1:自分のユーザアカウントを決めよう

3.ステップ2:デスクトップ環境を確認しよう

4.ステップ3:自分の好みにデスクトップ環境を整えよう

5.ステップ4:インターネットに接続しよう:LANへの接続方法

6.ステップ5:他のコンピュータとファイルを共有する

  • 〜その1:MacOSXのリソースをネットで共有する

7.ステップ6:他のコンピュータとファイルを共有する

  • 〜その2:他のマシンのファイルを自分のマシンで使えるようにする

8.MacOSXで使えるバイオ研究用無料ソフト

2章 UNIXのセットアップと日常的なバイオ実験への活用

1.セットアップの前にまずはファイル構造と用語を理解しよう

2.ステップ1:Finkを使ってUNIX環境を整えよう

3.ステップ2:X Window Systemを導入しよう

4.ステップ3:UNIXで日本語を使えるようにしよう

5.ステップ4:ウィンドウマネージャーGNOMEのインストール

6.ステップ5:UNIX系ソフトをインストールしよう

7.研究に役立つUNIX系ソフト

8.EMBOSSを日常的なバイオ実験に活用しよう!

3章 大量データ処理に活用しよう!

1.はじめに

2.公共データベースからデータをダウンロードする

3.データベースを構築して、公開する

4.ツールで解析する

5.プログラムを書いて、解析する

6.スクリプトやmakeで効率良く解析する

用語解説

  • アーカイブ
  • アーキテクチャ
  • アノテータ
  • アンチエイリアス処理
  • イーサネット
  • エクスプローラー
  • エミュレーター
  • オープンプロジェクト
  • カーネル(Kernel)
  • 外部キー
  • キャラクタコード
  • キュレータ
  • 近隣結合(Neighbour Joining:NJ)法
  • グローバルアライメント
  • コンソール
  • コンパイル
  • サーバデーモン
  • シェル
  • シェルスクリプト
  • 主キー
  • シンボリックリンク
  • スクラッチ
  • 正規表現
  • ソース
  • ターミナル
  • タスクマネージャー
  • タッピング機能
  • ディストリビューション
  • デリミタ
  • ドラッグ&ドロップ
  • 日本語ロケール
  • ノード
  • バイナリ
  • パッケージ化
  • パッチ
  • プレインテキスト
  • プロキシサーバ
  • プロンプト
  • ポート番号
  • ポストスクリプト形式
  • マルチプルアライメント
  • モジュール
  • ユーティリティー
  • レポジトリ
  • 連想配列(ハッシュ)
  • ローカルアカウント
  • ローカルアライメント
  • ADSL
  • Apache
  • API
  • apt-get
  • bash
  • BLAST
  • BSD(Berkeley Software Distribution)
  • BSD44
  • CGI/SSI
  • Classic
  • Carbon
  • Cocoa
  • Java
  • configureスクリプト
  • CUI
  • CVS
  • Darwin-ppc
  • deb形式
  • Debian GNU/Linux
  • DHCPサーバ
  • division id
  • dmgファイル
  • DNSサーバ
  • dselect
  • DTD(Document Type Definition)
  • editor
  • E-Value
  • Fasta形式
  • FinkCommander
  • FreeBSD
  • FTPクライアント
  • FTTH(PPPoE)
  • gcg形式
  • GenBankのdivision code
  • genetic code
  • GUI
  • IPアドレス
  • LAN
  • LOCALE(X_LOCALE)
  • Mach(マーク)
  • Makefile
  • MSF形式
  • MultiFasta形式
  • NEXTSTEP
  • NTPサーバ
  • OpenSSH
  • PNG形式
  • POP
  • APOP
  • IMAP
  • POPサーバ
  • SMTPサーバ
  • Quartz
  • RedHat
  • Samba
  • SMB
  • sshd
  • synonym
  • tax_id
  • tcsh
  • translation table
  • UTF-8
  • viエディタ
  • Vine
  • Xサーバ

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