エピジェネティクス実験プロトコール

ナビ編

序章　エピジェネティクス解析ナビ

1.エピジェネティクス解析の重要性【牛島俊和】

2.DNAメチル化解析ナビ【牛島俊和／服部奈緒子】

3.ヒストン化学修飾解析ナビ 【眞貝洋一】

実践編

1章　DNAメチル化解析

1.バイサルファイトシークエンシング【千葉初音／佐々木裕之】

2.MSPと定量的MSP 【丹羽　透／山下　聡／牛島俊和】

3.メチル化感受性制限酵素によるDNAメチル化検出【 ?井大哉】

4.COBRA法【鈴木　拓／豊田　実】

5.パイロシークエンス法?複数のCpGのメチル化を定量する【近藤　豊】

6.質量分析機（MassARRAYR）によるDNAメチル化定量解析【金田篤志】

7.DNAメチル化酵素の活性測定?放射性化合物を用いた活性測定【末武　勲／田嶋正二】

8.5-aza-dC処理（TSA処理含む）【山下　聡】

9.T-DMRメチル化レポーターアッセイ【佐藤　俊／塩田邦郎／田中　智】

2章　ヒストン化学修飾解析

1.ヒストン修飾抗体を用いたウエスタンブロット解析 【立花　誠】

2.クロマチン免疫沈降（ChIP）法【林　陽子／後藤友二／木村　宏】

3.HAT活性・HDAC活性測定 【伊藤昭博／前田里子／吉田　稔】

4.ヒストンメチル化活性測定【西岡憲一】

5.ヒストン脱メチル化活性測定?ウエスタンブロットおよび質量分析法【米沢理人／Andreas Schmidt】

3章　網羅的解析

1.メチル化DNA免疫沈降法（MeDIP法）?DNAメチル化領域を網羅的に検出する 【永江玄太／油谷浩幸】

2.DNAメチル化アレイ：MIAMI法【畑田出穂】

3.ChIP on chip法を用いた染色体構造の網羅的解析【坂東優篤／白髭克彦】

4.ChIP-Seq 【金井昭教／菅野純夫／鈴木　穣】

付録

1.汎用試薬リスト

2.ヒストン修飾制御マップ