基礎生物学研究所ゲノムインフォマティクストレーニングコース(GITC)
ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース 2021 夏
- 【コース概要】
- 生物情報学を専門としない生物学研究者を対象に，次世代シーケンシング（NGS）技術を使ったトランスクリプトーム解析（RNA-seq）をどのように実験デザインし，どのように膨大な遺伝子発現データから生物学的な情報を抽出するのか，その基礎的技術と考え方を身に付けることを目的としたコースです． 次世代シーケンスデータのフォーマットの理解などの基礎的事項から，ゲノム情報のない生物種でトランスクリプトーム解析を可能にするde novo RNA-seq 解析などの発展的内容までカバーします．講義とコンピュータを用いた演習を組み合わせて行います．本コースは，NGS解析入門とRNA-seq入門の２つから構成され，それぞれ2日間の日程で開催されます．NGS解析入門では，データ解析を行う際の共通の基盤として，UNIXオペレーティングシステムや統計解析パッケージRの基本的な使い方を学んだ上で，NGS解析と統計学の基礎を学習し，NGSデータ解析を想定した演習を行います．RNA-seq入門では，RNA-seqによる発現変動解析の原理を理解した上で，実践的なデータ解析パイプラインを習得します．
- 【日程と実習内容】
- ［NGS解析入門］2021年8月25日（水）10：00～8月26日（木）17：30／UNIX基礎，シェルスクリプト，R入門，NGS基本データフォーマット，NGS基本ツール，テキスト処理，統計学入門
［RNA-seq入門］2021年9月15日（水）10：00～9月16日（木）17：30／NGS基本データフォーマット復習，NGS 基本ツール，RNA-seq 基礎，多変量解析，機能アノテーションとGO解析 - 【オーガナイザー】
- 重信秀治（基礎生物学研究所・教授），内山郁夫（基礎生物学研究所・准教授）
- 【講師】
- 佐藤昌直（北海道大学），山口勝司，西出浩世，中村貴宣，杉浦宏樹（以上，基礎生物学研究所）
- 【場所】
- オンライン開催
- 【受講料】
- 無料
- 【受講対象者】
- 本トレーニングコースの受講対象者は，大学もしくは学術機関に所属する研究者，職員および学生といたします．
- 【申し込み方法】
- コースホームページをご覧ください． 申込締切：2021年7月25日（日）
- 【募集人数】
- 26名
