初心者でもわかる! バイオインフォマティクス入門〜やさしいUNIX操作から遺伝子・タンパク質解析まで

初心者でもわかる!

バイオインフォマティクス入門

やさしいUNIX操作から遺伝子・タンパク質解析まで

  • 坊農秀雅/著
  • 2002年10月04日発行
  • B5判
  • 158ページ
  • ISBN 978-4-89706-290-7
  • 定価:3,800円+税
  • 在庫:あり
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基本知識からかんたんなUNIX操作,必要なソフトの使い方と配列解析まで,これ1冊でよくわかる実践的な入門書! バイオインフォマティクスをはじめるのに最適の書です!

目次

【第1章 バイオインフォマティクスとは何か?】

◆ 1-1 バイオインフォマティクスで何ができるの?

  • はじめに〜私がバイオインフォマティクスと出会ったきっかけ
  • 「バイオインフォマティクス」とは何か?
  • バイオインフォマティクスでできること,できないこと

◆ 1-2 バイオインフォマティクス的なものの考え方

  • バイオインフォマティクスを勉強する心構え
  • バイオインフォマティクス勉強法(入門編)
  • バイオインフォマティクス勉強法(実践編)

◆ 1-3 バイオインフォマティクスと産業

  • これまでのバイオインフォマティクスと産業のかかわり
  • バイオインフォマティクスと産業のかかわりの実際
  • バイオインフォマティクスのビジネスモデル

◆ 1-4 バイオインフォマティクスと情報科学

  • 情報科学者とは?
  • 日本における「バイオインフォマティクス」研究の歴史
  • いかにして共同研究していくか

【第2章 必要なコンピュータ環境を作ろう】

◆ 2-1 バイオインフォマティクスとUNIX

  • UNIXとは
  • 実際にUNIXを使ってみよう
  • UNIXのシェルを使ってみよう
  • ソースとバイナリ

◆ 2-2 バイオインフォマティクスとインターネット

  • バイオインフォマティクスとインターネット

◆ 2-3 バイオインフォマティクスのためのコンピュータ環境を構築する

  • Linux編
  • MacOSX編
  • Cygwin編
  • バイオインフォマティクスツールのインストール

◆ 2-4 データベースを個人で取得,管理する

  • FTP入門
  • fmirrorコマンド
  • CVSコマンド

◆ 2-5 自分でプログラ厶を組んでコンピュータを動かす

  • foreachを使いこなそう
  • foreachのルーチン化と新規遺伝子探索のためのログの作成
  • ログファイルからIDの数を数える

◆ 2-6 Bioperlを利用する

  • Bioperlとは
  • BLAST/FASTAパーザー
  • GenBankエントリー取得ツール

【第3章 実際の解析に挑戦してみよう】

◆ 3-1 公共データベースを使ってみよう!

  • 公共データベースとは?
  • 公共データベースの実際的な利用法〜配列相同性検索ツール
  • 公共データベースの実際的な利用例〜cDNA配列群の機能推定・機能注釈付け
  • 公共データベースの今後の課題

◆ 3-2 ゲノム情報の解析

  • はじめに
  • ゲノムアノテーション情報の作成
  • ゲノムアノテーション情報の取得
  • ゲノムアノテーション情報の利用

◆ 3-3 遺伝子多型情報の解析

  • SNPとは
  • SNPデータベースの利用
  • SNPと配列精度
  • SNP発見の実際

◆ 3-4 ゲノム比較解析

  • ゲノム比較解析
  • 遺伝子群の解析

◆ 3-5 実際に遺伝子発現情報を解析しよう

  • 遺伝子発現情報データベース
  • DNAマイクロアレイによる発現情報解析の実際
  • マイクロアレイの標準化,公共データベース化

【第4章 最新の研究をのぞいてみよう】

◆ 4-1 バイオインフォマティクスを研究する

  • バイオインフォマティクスの研究とは?
  • これからのバイオインフォマティクス研究の方向性
  • 遺伝子機能情報のコンピュータ化

◆ 4-2 バイオインフォマティクス研究の実例:筆者の場合

  • cDNAマイクロアレイ解析のためのUNIX環境
  • cDNAマイクロアレイ解析に用いるデータとは
  • cDNAマイクロアレイによるデータマイニングの実際

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  • 【本書名】初心者でもわかる! バイオインフォマティクス入門〜やさしいUNIX操作から遺伝子・タンパク質解析まで
  • 【出版社名】羊土社

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