バイオテクノロジージャーナル2006年7-8月号
| 分類 | サイト名 | 備考 |
|---|---|---|
| ●プライマー設計ソフト | yamPCR | マルチプレックスPCR用のプライマー設計ソフト |
| ●タンパク質機能解析データベース | Catalytic Site Atlas | 触媒残基を登録しているデータベース |
| CATH | タンパク質立体構造分類データベース | |
| ConSurf | 物理化学的な特徴を表面へマップすることで機能部位予測 | |
| DISOPRED2 | Disorder領域の予測 | |
| DynDom | タンパク質の構造変化 | |
| eF-site | http://ef-site.hgc.jp/eF-site/ | |
| eF-surf | 分子表面および静電ポテンシャルを計算 | |
| ETS | タンパク質配列の保存部位の抽出と機能部位推定 | |
| EzCatDB | 酵素の活性部位データベース | |
| FORTE | タンパク質の立体構造予測 | |
| GRASS | 分子表面と静電ポテンシャルの計算 | |
| MACiE | 酵素関連データベース | |
| MODELLER | 構造モデリング用ソフトウェア | |
| MolMovDB | 階層的に構造変化を分類したデータベース | |
| p-cats | 保存残基の環境適合性から機能部位残基を予測 | |
| PQS | タンパク質の複合体の推定 | |
| PreBI | タンパク質複合体の予測 | |
| PreDs | DNA結合部位を予測 | |
| ProMode | １つの構造を入力として受け取り，基準振動解析法でin silicoに構造変化を生成 | |
| ROBETTA | 新規構立体構造モデルの構築 | |
| Verify3D | 二次構造や残基の埋没度などタンパク質構造らしさを残基単位で評価 |
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