改訂版のはじめに

初版のはじめに

初版への巻頭言【大隅良典】

第1部 査読のリアル

1 査読依頼がきたら

ピアレビューシステムの原則

査読依頼を引き受けるべきか

断るべき時

世界の動向

2 査読の心得

何を評価すべきか

①正当性

②論理性（主要な結論が論理的にサポートされているか）

③新規性

④重要性

⑤普遍性

⑥倫理性

⑦論文の体裁

コメントすべきではないこと

universal principled review template の提案

総説の査読の場合

改訂論文の評価

英語について

査読者も評価されている

3 査読の実際

プリントアウトすべきか

PC 画面で効率よく査読する方法

研究室メンバー内外のヘルプ

コメントの書き方

書き方の例

エディターへの秘密のコメント欄

AI の利用について

補足

4 査読システムの試行錯誤

査読と論文出版に関連する問題点

査読の仕組みはジャーナルによって異なる

レフェリーコメントの相互閲覧（cross-review）

査読コメントのリサイクル：他のジャーナルへのトランスファー

査読コメントの公開

査読者名の公開

ダブルブラインド

eLife のユニークな査読プロセス

2023 年1 月から始まったeLife の「新モデル」

新しい査読の共通プラットフォーム「Review Commons」

プレプリントサーバー：「査読後に公開」から「公開後に査読」へ

5 査読者へのインセンティブ

査読者枯渇の危機：完全にボランティアでよいのか？

お金で解決できるか？

査読者名の公表による感謝の意の表明

査読証明書の発行

ジャーナルやデータベースの無料購読サービス

オープンアクセスジャーナルへの掲載料無料サービス

アクセプト率が高くなるのではないかという期待は無駄

第1部の最後に

第2部 特別座談会

第2部 特別座談会 Profile

1 私たちの査読のリアル【水島 昇（司会），今井眞一郎，田口英樹，中山敬一】

はじめに

自己紹介と現在の査読への取り組み

査読を引き受ける・引き受けないの線引きは？

査読者コメントの長さはどのくらいが理想か？

査読者は「建設的」であるべきか？

査読の実際，三者三様

査読者コメントから査読者はばれるのか？

プレプリントサーバーに出す理由・出さない理由

理想の論文評価システムはどのような形か

査読者やコメントの透明性は何をもたらすのか

査読者へのインセンティブ

査読を通じてサイエンスを育み，楽しもう

2 査読のあり方を通じて科学を考える【水島 昇（司会），田口英樹，中山敬一，谷内江 望】

はじめに

自己紹介と現在の査読への取り組み

もはや情報収集に欠かせなくなったプレプリント

査読コメントの公開はどのように影響するか

公開されたビッグデータは査読で確認すべきか

生成AI は査読者の立場に取って代わるのか？

ラボメンバーを誘う？ 誘わない？ 査読教育のあり方を考える

査読プロセスの課題解決に挑むeLife の取り組み

あらためて，査読者の役割とは

査読のあり方を考えることは，科学の本質を考えること

3 eLifeの新査読システムと研究評価の理想像【水島 昇（司会），Alessio Bolognesi】

はじめに

アクセプト/ リジェクトの決定に基づくこれまでの出版システムの限界

アクセプト/ リジェクトの決定を排除したeLife の新モデル

新モデルに対するコミュニティの反応と論文の質

査読の未来を模索するさまざまな取り組み

多すぎるプレプリントから読むべき論文を見つける方法は？

若手研究者は査読の経験をいかに積むべきか？

第3部 査読例文集

はじめに

人称について

時制について

1 論文全体に関わるコメントに使える英語表現

論文の要約

書き出し ／ この論文の発見は ／ 過去の論文の延長の場合の書き出し

研究分野に関するコメント

肯定的な意見

新規性がある ／ 新しい点は ／ 質が高い ／ データに説得力がある ／ 重要な研究である ／ これまでの問題を解決した ／ 興味深い ／ 良くデザインされている ／ よく書けている ／ データから結論がよく支持されている ／ 特に修正や欠点はない

否定的な意見

部分的には良いがという定型句 ／ 正当性（正しい方法，データの質） ／ 論理性 ／ 新規性 ／ 重要性（インパクト） ／ 普遍性

論文全体に関わるコメントのまとめ

まとめの枕詞 ／ 総じて良い論文である ／ 指摘した点に答えれば論文を強めるであろう ／ さらなる情報や実験が必要 ／ 出版には値しない ／ リバイスしてもダメだろう ／ 問題が多すぎてすべて挙げられない ／ マイナーコメントがあるのみ ／ 以下，コメント ／ 絶対に答えないといけないことはない

2 具体的なコメントに使える英語表現

ページや図を指定する

データを言及しつつ指摘する

主な欠点は

データの良くない点を具体的に指摘する

説得力がない，十分ではない ／ 解釈が困難，紛らわしい ／ データに矛盾がある ／ データの質が低い ／ 差がわずか ／ ～の解析がない ／ 何かがおかしい ／ このような疑問が生じるだろう

方法が適切ではない

レポーターや方法が適切ではない ／ 方法や細胞に一貫性がない ／ 他の方法でも確認すべき ／ 過去の論文にあるから正しいというわけではない ／ 適切な方法に関する文献紹介

既報告との関連

すでに報告がある ／ 過去の報告と異なる ／ 過去の報告を無視している ／ 既報告を考慮すべき

文献引用

引用が不適切 ／ 引用を追加すべき

議論，解釈

～が直接の原因かどうかわからない ／ 推測でしかない ／ この点を議論すべきである ／ Discussion がよくない ／ データから支持されない ／ データからはそのようには読み取れない ／ 本当に代表例か？ ／ モデルと矛盾する ／ 結論を和らげるべき ／ 違う解釈が可能 ／ 何通りにも解釈できる ／ もっと慎重に解釈すべき ／ ～を気にとめておくべき

追加実験の要求

～を調べるべき，～の実験をすべき（強い提案） ／ ～するとよいだろう（弱い提案またはしなくてもよい） ／ より良いデータと差し替えるように

コントロール

コントロールが足りない，適切ではない ／ 抗体の特異性

説明不足

より詳しい説明が必要 ／ まちがった印象を与えないように ／ プレゼンテーションが悪い ／ 意味がわからない ／ 本文で記載するように ／ マテリアルや方法の情報が不足 ／ タイムポイントが不明

定量

定量が必要（全般） ／ 電気泳動の定量 ／ 顕微鏡画像の定量 ／ 定量はリニアな範囲で ／ 定量結果が呈示データを反映しない ／ % は何を示す？

統計・定量・有意差

統計処理が必要 ／ 統計処理方法が不明 ／ 独立した実験で確認しているか？ ／ n 数が不明 ／ 多群解析が必要

タイムコースが必要

遺伝子導入実験

過剰発現に依存しすぎている ／ 内在性を見るべき ／ 発現量の違いが影響しているのでは？

電気泳動データ

シグナルが飽和している ／ バンドが見にくい，暗い ／ コントラストが強すぎ ／ 分子量マーカーがない ／ ローディングコントロールが必要 ／ ローディングコントロールが不適切 ／ 免疫沈降の効率について ／ 同じブロット上で見るべき ／ 非連続レーンを単一データにした場合

顕微鏡データ

画像の質が悪い ／ 何を見ているかよくわからない ／ 小さくてよくわからない ／ 蛍光の漏れがないかどうか ／ 拡大像が必要 ／ 重ね合わせ像だけでは不十分 ／ 単色はグレースケールがよい ／ 解像度が足りない ／ ライブイメージングが必要 ／ 共局在について ／ スケールバーがない ／ 矢印があった方が良い

RNAi データ

発現抑制を示すように ／ siRNA の特異性を示すように

論文の体裁

間違いが多すぎる ／ 「data not shown」を見せるように ／ 定量結果だけではなく生データを出さないように ／ ページ番号をつけるように ／ 書き間違い ／ 英語校正，推敲が必要 ／ 省略形が不明 ／ 標記方法を統一するように ／ 削除した方が良い ／ 他の部分とフィットしない ／ 字が小さくて見えない

図の体裁

図の番号やラベルが必要 ／ 図を順番に説明すること ／ 図の構成についての助言 ／ 図のラベルが不適切 ／ 図の説明（legends）が不適切 ／ 模式図があるとよい

つなぎの言葉

同様に ／ さらなる懸念は ／ 些細なことではあるが ／ これは大事なので ／ 一般読者にとってもっとわかりやすくするために

3 改訂版（リバイス）原稿へのコメントに使える英語表現

対応は十分

あと少し

まだ問題あり

コメントに応じていない

説明せずにデータを削除するのは良くない

レターだけではなく論文にデータを含めるように

4 エディターへのコメントに使える英語表現

掲載を勧める

改訂後のPublication を勧める

雑誌のレベルに足りない

リジェクトとしたけれど見直しても良い

少し躊躇するけれどリジェクト

5 総説へのコメント に使える英語表現

良くまとまっている

良く書けている

タイムリーである

バランスがとれている，客観性がある

自分たちの仕事を強調しすぎ

他の総説と重複している

6 やむを得ず辞退する場合に使える英語表現

お礼

本来は引き受けたいところ

専門外

この分野の研究はもうやっていない

他にたくさん査読中

他の査読さえ間に合わない

出張や休暇で読めない

忙しくて無理

共同研究なので不適切

利益相反がある

すでに見た

少し長目に時間が欲しい

お詫び

他を推薦

索引

査読者・エディターからのアドバイス

❶ Figure（図）にLegend（図の説明）を書き込む

❷ 「interestingly」や「surprisingly」は使わない

❸ サプリメントはなるべく少なく

❹ 字が小さすぎて見えない！

❺ 通し行番号をつける

❻ 査読候補者名を挙げる

❼ エディター・査読者を悩ませない