実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:ロングリードWET&DRY解析ガイド シークエンスをもっと自由に!〜リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術
実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ

ロングリードWET&DRY解析ガイド シークエンスをもっと自由に!

リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術

  • 荒川和晴,宮本真理/編
  • 2021年09月17日発行
  • B5判
  • 230ページ
  • ISBN 978-4-7581-2253-5
  • 定価:6,930円(本体6,300円+税)
  • 在庫:あり
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手のひらに載る超小型「次世代シークエンサー」として大きな注目を浴びたMinIONも,正式リリースからすでに5年が経った.技術的にも成熟し,DNAもRNAも増幅なしで直接読める1分子リアルタイムシークエンサーとして,ナノポアシークエンサーは今さまざまな医薬・生命科学の領域で活用が進んでいる.ゲノムシークエンス技術は今や分子生物学的アプローチに不可欠な存在だ.いつでも,どこでも,誰でもシークエンシングを行える時代を,本書とともに楽しんでいただきたい.…

荒川和晴(慶應義塾大学先端生命科学研究所)

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精度が向上し,導入のしやすさや応用性の高さで新たな強みを示すロングリード技術を活用して新発見を掴むための実践プロトコール集.実例に裏打ちされたWET・DRY双方のノウハウが満載.

目次

序【荒川和晴,宮本真理】

第1章 Introduction

1 序論:誰もがゲノムシークエンシングできる時代に【荒川和晴】

2 ナノポアシークエンスの原理と技術発展【宮本真理】

3 DRY解析環境のセットアップとデータ解析プラットフォームGalaxyの使い方【大田達郎,志波 優】

4 ナノポアシークエンス実践ガイド 〜ライブラリプレップから解析環境選びまで【上村泰央】

第2章 プロトコール① リピートと構造変異

1 動物の長鎖リピート解析(クモ糸を例に)【河野暢明】

2 ヒト疾患関連の長鎖リピート解析【三橋里美】

3 ヒト疾患関連のSV解析【坂本祥駿,三宅修平,岡 実穂,鈴木 穣,鈴木絢子】

4 核酸の塩基修飾解析【古田芳一】

5 メガベースをめざせ!ultra-long readプロトコール【中村浩之,河野暢明,荒川和晴】

第3章 プロトコール② ゲノムアセンブリ

1 初めてでもできる!細菌ゲノムのアセンブル【谷口 誠】

2 和牛のde novoゲノムアセンブリ【若栗浩幸,今村聖実,佐々木慎二,鈴木 穣】

3 ナノポアで読む植物ゲノム【内藤 健】

第4章 発展的アプリケーション

1 direct RNA sequenceとRNA修飾の情報解析【上田宏生】

2 ナノポア技術によるオンサイト迅速細菌同定【松尾禎之】

3 ナノポアシークエンサーMinIONを活用したウイルス解析【中川 草】

索引

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  • 【出版社名】羊土社

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