細胞内での相互作用分子を網羅的に捉える技術として,急速に普及するビオチン標識法.ノイズに惑わされない正しい同定を導く戦略やコツから,様々な生物種での応用例まで,本書さえあれば今すぐあなたも実践できる!
目次
◆ 序【澤崎達也】
◆ 概論―近接依存性ビオチン標識法の原理・実際・応用【小迫英尊】
原理編
1 近接依存性ビオチン標識技術の選び方と解析の注意点【澤崎達也】
2 細胞,マウス個体へのビオチンリガーゼ導入法【奥山一生,谷内一郎】
3 ビオチン化タンパク質の検出・同定法と使い分け【小迫英尊】
実践編
Ⅰ.解析フロー
1 標識酵素融合遺伝子のコンストラクション【高橋宏隆】
2 BioID酵素融合遺伝子の培養細胞への導入【山中聡士】
3 イムノブロットによるビオチン標識の確認【高橋宏隆】
4 ビオチン化タンパク質の精製と質量分析による同定【小迫英尊】
5 近接タンパク質情報のバイオインフォマティクス【土方敦司】
6 in vitroでの生化学的相互作用解析【森下 了】
Ⅱ.各生物種での解析
7 マウス生体内BioID法の実践に向けたマウス作製法とビオチン化誘導法【谷内一郎,原田淳司】
8 AirID融合タンパク質発現シロイヌナズナの作出【野澤 彰,井上晋一郎】
9 出芽酵母におけるAirIDによる相互作用因子の同定【河田美幸,関藤孝之】
10 ショウジョウバエ生体における近接依存性標識プロテオミクス【川口紘平,藤田尚信】
応用編
1 Split-BioID法とその派生技術の可能性【永本紗也佳,髙野哲也,奥山一生】
2 BioID法に用いる酵素の構造的特徴【寺脇慎一】
3 Fab抗体を用した膜タンパク質の細胞外相互作用解析【山田航大】
4 HRP標識抗体を用いた構造特異的膜タンパク質の解析【小川優樹】
5 BioID法で解き明かす生体脳の空間プロテオーム【伊藤有紀,髙野哲也】
6 短時間のPPIを解析するためのBioID酵素【山中聡士】
◆ 索引
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- 【本書名】実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:リアルな相互作用を捉える近接依存性標識プロトコール〜BioID・TurboID・AirIDの選択・導入から正しい相互作用分子の同定まで、論文には書かれていない実験のノウハウ
- 【出版社名】羊土社
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第3地帯(アフリカ、南米) |
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