実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:AlphaFold時代の構造バイオインフォマティクス実践ガイド〜今日からできる!構造データの基本操作から相互作用の推定、タンパク質デザインまで
実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ

AlphaFold時代の構造バイオインフォマティクス実践ガイド

今日からできる!構造データの基本操作から相互作用の推定、タンパク質デザインまで

  • 富井健太郎/編
  • 2024年11月29日発行
  • B5判
  • 216ページ
  • 付録:構造解析用データファイル・動画
  • ISBN 978-4-7581-2276-4
  • 6,930(本体6,300円+税)
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2024年ノーベル化学賞のテーマ「AlphaFold」を扱う本邦初の実験書.どのツールをどう使えばいいか,実践的な解説が満載.本書を片手にタンパク質の「構造」から機能を探り,研究を一つ上のステージへ

目次

◆ 序【富井健太郎】

第1章 概論と基礎知識

1 構造バイオインフォマティクスへの招待【富井健太郎】

2 AlphaFold2の衝撃【大上雅史】

3 AlphaFoldの予測構造を読み解くための基礎知識【西 羽美】

第2章 立体構造データの入手と可視化・簡易計測

1 立体構造データの可視化と解析のためのツール【山守 優】

2 各種立体構造データベースの種類と使い方【于 健,栗栖源嗣】

3 タンパク質の立体構造予測 〜ColabFoldとAlphaFold2〜【森脇由隆】

第3章 立体構造によるタンパク質の機能推定

1 タンパク質–タンパク質の相互作用予測 〜AlphaFold-MultimerとAlphaFold3〜【森脇由隆】

2 分子ドッキング法 〜タンパク質–化合物複合体の構造予測〜【石谷隆一郎,力丸健太郎】

3 MDシミュレーション 〜予測構造モデルの安定性や結合の強さを検証する〜【寺田 透】

4 構造比較 〜立体構造を検索して比較する〜【木原大亮】

第4章 応用・発展的研究

1 タンパク質の構造変化予測 〜AlphaFoldと分子動力学の統合〜【岡崎圭一,大貫 隼】

2 タンパク質デザインAIの動向と利用のコツ【小林直也】

3 AlphaMissenseによる変異導入効果予測 〜タンパク質言語モデルと立体構造予測の融合【山口秀輝,齋藤 裕】

◆ 索引

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  • 【本書名】実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:AlphaFold時代の構造バイオインフォマティクス実践ガイド〜今日からできる!構造データの基本操作から相互作用の推定、タンパク質デザインまで
  • 【出版社名】羊土社

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