実験医学 2021年9月号 Vol.39 No.14

空間トランスクリプトーム

細胞内局在から組織構成まで、遺伝子発現の位置情報がわかる!

  • 沖 真弥,大川恭行/企画
  • 2021年08月20日発行
  • B5判
  • 131ページ
  • ISBN 978-4-7581-2547-5
  • 定価:2,200円(本体2,000円+税)
  • 在庫:あり
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企画者のことば

多細胞システムは,空間的に整然と配置された多彩な組織や細胞型によって構成される.その細胞型の空間的な分布や固有の機能は遺伝子発現プロファイリングによって解析されるが,従来のin situ hybridization法や免疫染色ではすべての遺伝子を網羅するのは難しい.ごく最近,空間トランスクリプトームと総称される実験技術の開発により,網羅的な遺伝子発現プロファイルを空間情報と紐づけて解析できる時代が到来した.本特集では,さまざまな空間トランスクリプトーム技術の開発者に加えてユーザーにも寄稿してもらい,各技術の原理,スペック,導入コスト,長所や短所などについて紹介する.…

沖 真弥(京都大学大学院医学研究科創薬医学講座),大川恭行(九州大学生体防御医学研究所トランスクリプトミクス分野)

特集の概論を読む

従来の網羅的発現解析では困難な,組織や細胞内の発現分布を得る! 複数の最先端技術についてスペックから導入事例まで,開発者と利用者の双方に執筆いただきました/他,「貪食」の多様性に迫る最新研究にも注目

目次

特集

空間トランスクリプトーム〜細胞内局在から組織構成まで、遺伝子発現の位置情報がわかる!
企画/沖 真弥,大川恭行
概論―空間トランスクリプトーム技術の最前線【沖 真弥,大川恭行】
Photo-Isolation Chemistry:光照射による高解像度かつ高感度なトランスクリプトーム技術【本田瑞季,沖 真弥】
GeoMx®による全RNAとタンパク質発現のデジタル空間解析【植松 隆】
RNA/DNA seqFISH+法による単一細胞レベルでの核内三次元地図の取得【武井洋大】
10x Visiumによる空間トランスクリプトーム解析【水野 林,小林由佳,河岡慎平】
CODEX Technologyを使ってみた【宮脇恒太】

いま知りたい!!

かじる? 呑み込む? 貪食の多様性 ―トロゴサイトーシスとエフェロサイトーシス
企画/森岡 翔
1)概論―貪食の多様性から見る新たな細胞間コミュニケーションの世界【山岡優佑,新井洋平,森岡 翔】
2)トロゴサイトーシスによる免疫細胞機能の調節【三宅健介,烏山 一】
3)寄生性原生生物から見えるトロゴサイトーシスの新しい分子機構【津久井久美子,野崎智義】
4)がんおよびがん免疫治療におけるトロゴサイトーシス【川島雅晴,幸谷 愛】

連載

News & Hot Paper Digest
針なし吸入ワクチンの新規展開:肺粘膜免疫の誘導【柏木 哲】
グライコRNAワールドへの扉?【金川 基】
見落とされていたタンパク質内化学結合【加藤英明】
好中球由来エラスターゼが誘導するがん細胞特異的な死【新妻耕太】
カレントトピックス
クロマチンリモデリング因子DDM1によるパラサイトDNAの鎮静化機構【越阪部晃永,Frédéric Berger】
小さなRNAが制御するピロリ菌の環境適応,持続感染と胃がん【木下 遼,三室仁美】
「空腹」による食べ物の匂い嗜好性増強の神経基盤【堀尾奈央】
ハープ現象の発見:DNゲルでがん幹細胞を創り出す【田中伸哉,鈴鹿 淳,王 磊,津田真寿美,龔 剣萍,高阪真路,間野博行】
不要細胞における“eat-me”シグナルの露出に関与するDNA修復タンパク質XRCC4の新たな役割【圓岡真宏,Panpan Zhang,鈴木 淳】
クローズアップ実験法
三次元自動細胞追跡ツール:3DeeCellTrackerで解析できることと使い方【Chentao Wen,木村幸太郎】
ライティングのプロが直伝!査読者の“脳をつかむ” 論文執筆術
一読しただけで意味がわかる文章を書くには【布施雄士】
ラボレポート―独立編―
東京からボストン,そしてスウェーデンへ―ラボの立ち上げに至るまで―Department of Chemistry and Molecular Biology, University of Gothenburg【澁谷大輝】
Opinion-研究の現場から
コロナ禍における若手同士のつながり【田中達基】
フィクションで読む最新論文
毒をのむ日【西園啓文】
バイオでパズる!
立体のパズル【山田力志】

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  • 【本書名】実験医学:空間トランスクリプトーム〜細胞内局在から組織構成まで、遺伝子発現の位置情報がわかる!
  • 【出版社名】羊土社

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