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【スマホで読める実験医学】遺伝子アノテーションの最適化による単一細胞RNA-seqデータ解析の精度向上
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遺伝子アノテーションの最適化による単一細胞RNA-seqデータ解析の精度向上
Recovery of missing single-cell RNA-sequencing data with optimized transcriptomic references
Pool AH, et al：Nat Methods, 20：1506-1515, 2023
Yuki Oka：Division of Biology and Biological Engineering, California Institute of Technology（カリフォルニア工科大学生物・生物工学科）
10.18958/7427-00003-0001364-00
単一細胞RNA-seqは細胞多様性の解析に必須のツールである．しかし，得られるシークエンシングリードの多くが遺伝子アノテーションの不備，イントロンマッピング，そして遺伝子重複マッピングにより失われていることがわかった．本論文では，それぞれの解析過程でのリード欠損を解析しそれらを回収するアルゴリズムを紹介する．
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