数万種類に及ぶ多数のDNAの部分配列を高密度に配置した「DNA chip」を用いた網羅的遺伝子解析法のことをDNA chip法という.プローブと呼ばれる既知遺伝子のDNA断片とサンプルから抽出したmRNA由来の相補的DNA (cDNA)をハイブリダイゼーションさせることで,サンプルの遺伝子発現プロファイルを評価する.