インターカレーターは,DNA二重らせんの塩基対間に平行挿入(インターカレート)する化合物群の総称である.特にDNA二重らせんとの複合体においてインターカレーター分子に存在する2つの置換基が主溝と副溝に位置するものを縫い込み型インターカレーターと呼ばれている.これは,DNA二重らせんとの複合体形成過程において置換基の1つがDNA塩基対間を通り抜けることに由来している.二本鎖DNAに結合した縫い込み型インターカレーターは,そのトポロジーから特に安定化される.