Creはファージから単離されたDNAリコンビナーゼで,2個のloxp 配列(ATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTAT)を認識してその間の配列を切り出す.loxp配列の変異配列がいくつか知られており(loxN,lox2272など),Creは完全に同一の配列同士の間のDNA配列のみしか切り出すことができない性質がある.