2-ニトロイミダゾール誘導体であり,低酸素状態にある生きた細胞の中に取り込まれてタンパク質のチオール基に結合する.抗pimonidazole抗体を用いることで低酸素状態にある細胞を免疫染色やELISA,フローサイトメトリーで検出することができる.