化合物にはいわゆる合成試薬と言われる反応性の高い化合物が多く存在する.反応性が高い化合物は水により分解したり,生体分子と共有結合をつくったりして,選択的に標的分子との結合が期待できない.あるいは,生体内で代謝を受けやすい構造や毒性を示しやすい構造も知られている.そのような創薬目的に相応しくなく,除外すべき構造のことである.