ここで直交性とは,改変(人工)型リボソームが細胞内で(つまり内在性のmRNAやtRNAなど翻訳を起こすために必要なものがそろった環境で)人工型mRNAだけを鋳型としてタンパク質合成を行う様.内在性翻訳反応とは独立して,またそれを干渉することなく,つまり細胞の生命を脅かすことなく,翻訳反応の要求性(rRNAにおける必須塩基やリボソームタンパク質の必須アミノ酸など)を探索することができる.