胞子形成・減数分裂における染色体の相同組換えを利用した遺伝的解析手法のひとつ.酵母をはじめ,胞子形成が可能な生物で用いられる.二倍体から形成される4つの胞子を顕微鏡下で分離し,それぞれの表現型を観察することにより目的遺伝子を解析する.四分子解析の応用例の1つとして,必須遺伝子の判定がある.