2007〜2011年度の5年間で行われるタンパク質の構造および機能解析のプロジェクト.予定総予算額は371億円.前段のタンパク3000プロジェクトの成果が産業応用の面では課題を残したことを受け,数値目標は設けずに高難度なタンパク質の解析を目標としている.