タンパク質の分子内には,自己および周囲のタンパク質の折りたたみや集合に必須で,その役割を終えると,プロテアーゼによって切除される領域が存在することがある.この成熟タンパク質には存在しないが,必須領域は分子内シャペロンと呼ばれる.例えば,枯草菌のプロテアーゼであるスブチリシンなどがよく知られる.