一次配列上E2ときわめて似た配列を有しているが,E2の活性中心であるシステインが他のアミノ酸に置き換わっているため,それ自体ではE2活性をもたないもの.ヒトではUBE2V2(MMS2),UBE2V1(CROC1)などが知られている.Ubc13はMms2もしくはCROC1とヘテロ二量体を形成し,ユビキチンのリシン63を介したポリユビキチン化反応を触媒する.