フォワード・ジェネティクス研究の場合,LODスコアは,マウス系統によって異なる一塩基多型マーカーと,表現型をひき起こすと想定される変異が,染色体上で物理的に近くに存在しているかどうかを推定するための統計学的値である.LODスコアが3以上あれば統計学的には有意である.LODスコアが大きいほど,表現型により強い影響を与える遺伝子変異が存在する可能性が高まる.