親から受け継いだ変異ではなく,ある個体において新しく発生した変異のこと.DNA複製過程のエラーによって生じ,点変異,短い挿入欠失変異か ら,数kbに及ぶコピー数変異,染色体レベルの変異まで,さまざまなサイズのものがある.