染色体の乗換え(chromosomal crossover)は,通常相同な染色体上の同じ座位で起きるが,反復配列やトランスポゾンの存在によって異なる染色体座位の間で乗換えが起きる現象.不等乗換えは遺伝子の重複や欠失の原因になるほか,非コード反復配列の増加や現象をもたらす主要な機構と考えられている.