PGCがその運命決定前に付加されたエピゲノム情報をいったん消去し,配偶子形成に向けて再編成する機構.ゲノムワイドなDNA脱メチル化,不活性化X染色体の再活性化,ゲノムインプリントの消去,ヒストン修飾の置換などが起きる.