ultra deep sequence

文字通り,非常に深く読んだ配列のことをいう.主観的表現で特に回数が決まっているわけではないが,一万回以上読んだ場合に使われることが多いようである.次世代シークエンサーは配列のエラー率が高いので,ゲノム上の同じ位置を繰り返して読む必要があり,その繰り返し数を深度(depth)という.また,がん研究では正常細胞の混入やサブポピュレーション細胞の問題があるので,非常に深く読む必要がある場合がある.

実験医学増刊 Vol.32 No.12

参考書籍

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