T-RFLP(terminal-restriction fragment length polymorphism). 細菌の16SrRNA遺伝子を増幅し,制限酵素で処理してできたDNA断片の大きさと量の情報を分析して,存在する細菌の属種とその量を判定する方法である.菌種の同定は不可能であるが,科属レベルの解析が可能であり,人の糞便中のエンテロタイプの概要がわかる.