FASTA形式とは,1行目はコメント行として扱われ,その行頭は必ず“>”で始まり,2行目以降にアミノ酸(あるいは核酸)配列を1文字表記で記したファイル形式を指す.高速配列検索プログラムFASTAで用いられることに由来する.