化合物の化学的特徴を,部分構造の特性や物理化学的性質など数値化してあらわした特徴ベクトルを意味する.特徴の有無を1または0であらわしたフィンガープリントがさまざまなデータベースで類似度検索等に使用されている.特徴の要素は整数や実数であらわす場合もあり,ケモインフォマティクスの分野で数多くの記述子が開発されている.