プロリンはアミノ酸のなかで唯一の環状2級アミン構造を有する.NH基をもたないので,ペプチド鎖中では分子内あるいは分子間βシート構造をとりにくく,ターン構造をとりやすい特徴がある.したがって,あるペプチド鎖のアミノ酸残基を1つずつプロリン残基で置換して構造機能解析を行うことにより,そのペプチドの二次構造に関する情報を得ることができる.