DNAの両鎖をシークエンスし,アライメントすることでエラー補正することができる手法.このため片側のみシークエンスする手法よりも配列の精度が高いと考えられる.現在ではさらに精度が向上したライブラリ調製の1D2 Sequencing Kit が販売されている.