ベクターが何らかの遺伝子内部に挿入した場合に,その遺伝子の転写活性を測定できるように人工エキソンをベクター内部に組み込んでおく.それらの遺伝子が発現するmRNAに取り込まれた人工エキソンの量をリアルタイムPCRにより定量する.このようにして定量された人工エキソンの量をエンハンサーのないコントロールベクターと比較することにより,ベクターが挿入した遺伝子に与えた影響を全体的な平均値として算出する.