重複遺伝子は多くの場合片方が失われるが,ある個体では一方の重複遺伝子が失われ,別の個体ではもう一方の重複遺伝子が失われるという場合もある.このように,2つのゲノム中から重複遺伝子の異なるコピーが失われることをreciprocal gene lossという.