パラミクソウイルス科はゲノム構造の違いによりニューモウイルス亜科とパラミクソウイルス亜科に分類される.パラミクソウイルス亜科はさらにレスピロウイルス属,モルビリウイルス属,ヘニパウイルス属,アビウイルス属,ルブラウイルス属に細分類される.