2. Windowsで始める環境構築

はじめに

日常の文書作成やデータ管理にWindowsを使用している研究者は多い．一方，バイオインフォマティクスで利用される解析ツールの多くは，Linuxを主な実行環境として開発されてきた．そのため，かつてWindowsはバイオインフォマティクス解析に適した環境とは言い難かった．しかし，Microsoftが提供するWSL2（Windows Subsystem for Linux 2）の登場により，Windowsを通常どおり利用しながら，代表的なLinuxディストリビューションの一つであるUbuntuのターミナルを開き，Linux向けの解析ツールを実行できるようになった．Windowsのデータ解析への利用は，Windows向けソフトウェアを用いる通常業務との両立，コンピューターの選択肢の広さ，ハードウェアをカスタマイズしやすいことなどの利点もある．本稿では，Windows11上にWSL2を導入し，Ubuntuとconda環境を利用して解析を始めるまでの基本的な流れを示す．