実験医学別冊:論文図表を読む作法〜はじめて出会う実験&解析法も正しく解釈!生命科学・医学論文をスラスラ読むためのFigure事典
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実験医学別冊

論文図表を読む作法

はじめて出会う実験&解析法も正しく解釈!生命科学・医学論文をスラスラ読むためのFigure事典

  • 牛島俊和,中山敬一/編
  • 2022年06月30日発行
  • A5判
  • 288ページ
  • ISBN 978-4-7581-2260-3
  • 定価:4,950円(本体4,500円+税)
  • 在庫:あり
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論文に使用される図表の種類が増えている.そのために,図表を理解するのがたいへんで,論文を読むこと自体を敬遠してしまう.「抄読会の準備があるので実験できません」などはもっての外だが,どうも本音はそうらしい.立派な大学院生は,実験書を読み,ネット検索をしながら勉強しているが,やはり時間がかかってしまう.じつは,自分も専門外の図表を解釈するのに苦労している.…

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トップジャーナルの図表を理解するのに苦労していませんか?115の頻出実験&解析法について,図表から「何がわかるのか」を簡潔にわかりやすく解説.初めて論文を読む学生・異分野の論文を読む研究者に頼れる1冊

目次

序【牛島俊和,中山敬一】

第1章 色々な解析に使えるエッセンシャル【編集協力:島村徹平】

1 統計的仮説検定とp

2 多重比較と多重検定補正

3 信頼区間

4 t検定

5 ANOVA

6 棒グラフ

7 相関解析

8 線形回帰

9 カーブフィッティング

第2章 核酸解析【編集:牛島俊和】

1 バイオアナライザ・TapeStationとRIN値・DIN値

2 アガロースゲル電気泳動

3 PCR/RT-PCR

4 定量的PCR

5 デジタルPCR

6 バイサルファイトシークエンス

7 G分染法

8 DNA-FISH解析

9 間期核FISH解析

10 Promoterアッセイ

11 Gel Shiftアッセイ

第3章 細胞の形態や性質の解析【編集協力:金田篤志】

1 免疫組織化学

2 蛍光染色

3 走査電子顕微鏡

4 透過電子顕微鏡

5 細胞増殖アッセイ

6 フローサイトメトリー

7 細胞周期

8 Annexin Ⅴ assay/Sub-G1 assay

9 TUNEL assay/Comet assay

10 薬剤感受性試験

11 細胞運動能アッセイ

12 Oil Red O染色

13 3D culture

14 造腫瘍性(同種・異種移植実験)

15 細胞老化

第4章 タンパク質解析【編集:中山敬一】

1 ポリアクリルアミド電気泳動

2 Western blot

3 二次元電気泳動

4 FRET

5 タンパク質半減期測定

6 ユビキチン化アッセイ

7 オーキシンデグロン法

8 PROTAC

9 Fluoppi

10 BiFC/SplitGFP

11 インターラクトーム解析

12 ELISA法

13 IP/RIP

14 カラムクロマトグラフィー

15 ショットガンプロテオミクス

16 ターゲットプロテオミクス

17 結晶構造解析

18 クライオ単粒子解析

19 NMR解析

20 表面プラズモン共鳴法

21 等温滴定型カロリメトリー

22 Phos-tag

23 インビトロヘリカーゼアッセイ

24 ショ糖密度勾配遠心法

25 高速AFM

第5章 代謝解析【編集協力:尾池雄一】

1 リピドミクス

2 細胞外フラックス解析

3 高血糖クランプ/高インスリン正常血糖クランプ

4 ブドウ糖負荷試験/インスリン負荷試験

5 メタボローム解析/代謝フラックス解析

6 代謝ケージによるマウス代謝測定

7 寒冷刺激試験

第6章 実験動物・遺伝子改変動物解析【編集:中山敬一】

1 CT

2 MRI

3 PET/SPECT

4 光イメージング

5 Cre/loxPシステム

6 遺伝学的系統追跡

7 電気生理学的手法

8 覚醒下脳イメージング

9 光遺伝学

10 オープンフィールド試験

11 モリス水迷路試験

12 Three-Chamber test

第7章 NGSなどを用いた網羅的解析【編集協力:兒島孝明】

共通

1 マイクロアレイ

2 Volcano plot

3 Pairwise scatter plot

4 Gene ontology解析

5 階層的クラスタリング

6 k-meansクラスター解析

7 PCA

8 メタジーン解析

9 モチーフ図

10 STRING(ネットワーク解析)

11 KEGG pathway

12 ネットワーク解析

変異とSNP(GWAS)

13 変異シグネチャー

14 Circos plot

15 Manhattan plot

16 Regional plot

17 ハプロタイプ

18 Accumulation curve

発現

19 MA plot(RNA-seq)

20 t-SNE/UMAP(シングルセルRNA-seq)

21 Trajectory 解析/Pseudotime解析

22 RNA velocity解析

23 TCR/BCRレパトア解析

24 Ribo-seq

エピゲノム解析

25 ChIP-seq

26 ATAC-seq

27 Hi-C

第8章 マイクロバイオーム・メタゲノム解析【編集協力:長谷耕二】

1 16SリボソームRNA配列解析

2 ショットガン・メタゲノム解析

3 注釈付き系統樹

4 α多様性解析

5 β多様性解析

第9章 臨床情報解析【編集協力:山本精一郎】

1 Kaplan-Meier法

2 ROC曲線

3 多変量解析

4 メタアナリシス

索引

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