基礎からわかる
ゲノム解析実験法
中村祐輔ラボ・マニュアル
- 2002年04月05日発行
- B5判
- 261ページ
- 付録：CD-ROM
- ISBN 978-4-89706-275-4
- 定価：6,490円（本体5,900円＋税）
- 注文不可
在庫：なし
東大医科研の中村祐輔研究室の最新版プロトコールを大公開！ どこの研究室でも必要とされる基本的な実験から最先端のマイクロアレイまでわかりやすく解説しています。付属CD-ROMで、マイクロアレイやSNP解析の実際の操作が一目瞭然！ 初心者から専門家まで納得のいく一冊です．
目次
第１章 遺伝子クローニング
- 高分子量DNAの単離 【飯田有俊／片桐豊雅】
- 全RNAの単離 【久湊顕彦／片桐豊雅】
- mRNAの精製 【久湊顕彦／片桐豊雅】
- 制限酵素によるDNAの切断 【片桐豊雅／井上耕一】
- ゲルからのDNA断片の回収 【片桐豊雅／尾崎浩一】
- ライゲーション 【片桐豊雅／田中敏博】
- 大腸菌の形質転換 【片桐豊雅／尾内善広】
- プラスミドDNAおよびコスミドDNAの調製 【片桐豊雅】
- サザントランスファー 【飯田有俊／片桐豊雅】
- 核酸の標識 【尾崎浩一／片桐豊雅】
- ハイブリダイゼーション 【尾崎浩一／片桐豊雅】
- ゲノムライブラリーの作製 【片桐豊雅】
- cDNAライブラリーの作製 【片桐豊雅】
- プラーク・コロニーハイブリダイゼーション 【片桐豊雅／田中敏博】
- PCR反応とその注意点 【片桐豊雅／田中敏博】
- ダイレクト サイクルシークエンス法 【岩佐泰靖／田中敏博】
- キャピラリーシークエンサーの使用法 【芳賀久典／川上弘人／田中敏博】
第２章 遺伝子の発現・機能解析
- RT-PCR：逆転写反応によるcDNAテンプレートの合成 【木村隆／藤澤淑子】
- RACE法 【片桐豊雅／尾崎浩一】
- SSCP法 【片桐豊雅／田中敏博】
- ノーザントランスファー 【山崎慶子／佐々木志織】
- ノーザンハイブリダイゼーション 【尹景雅／鈴木由希子】
- SDS-PAGEとウエスタンブロッティング 【松田浩一／谷川千津】
- 細胞からのタンパク質抽出とその定量 【谷川千津】
- 大腸菌における融合タンパク質の発現と精製 【片桐豊雅】
- in vitro translation 【穴澤嘉雄／湯川和子】
- 免疫沈降法 【呉晶晶】
- two-hybridシステム 【呉晶晶】
第３章 細胞レベルでの遺伝子機能解析
- 細胞培養 【尾之上さくら】
- 細胞への遺伝子導入法 【中島由美／柳生隆一郎／渡辺武志】
- 免疫染色法 【加藤達史／長谷川傑／牧野多絵】
- ルシフェラーゼ・アッセイ 【高橋めい子／田中由香】
- ゲルシフト・アッセイ（EMSA） 【浜本隆二／古川洋一】
- コロニーフォーメイションアッセイ（コロニー形成法） 【中西寛／近藤貴巳江】
- アンチセンス・オリゴ 【越智健介】
- アポトーシスアッセイ 【吉田浩二／松田浩一／飯泉明宮美】
- フローサイトメトリー（FCM） 【下川卓志／三輪晋智／李美華】
- アデノウイルスベクターの作製 【鵜木元香】
第４章 ポストゲノムシークエンス研究における最先端遺伝子解析技術
１）cDNAマイクロアレイ
- 1-1 cDNAマイクロアレイ上に配置するcDNAの作製 【前佛均／中村透】
- 1-2 スポッティング 【金田靖行／長山聡】
- 1-3 プローブの調製 【菊地剛史／柿内聡司】
- 1-4 ハイブリダイゼーション 【立入誠司／越智健介／久湊顕彦】
- 1-5 シグナル検出から数量化まで 【堀越研一／岡田晃一／柳川錬平】
２）Real-time PCRによる遺伝子発現量比較 【山中康成／柳川錬平】
３）インベーダー法による一塩基多型（SNP）タイピング法 【関根章博／廣谷賢志／北本卓也／坂元努】
４）TaqMan-PCR法による一塩基多型（SNP）タイピング法 【大西洋三／尾崎浩一】
付録
- よく使う試薬の調製法 【片桐豊雅】
付録CD-ROMメニュー
◆ cDNAマイクロアレイTips & Troubleshooting
- cDNAマイクロアレイの原理
- スポッティング
- プローブの調製
- ハイブリダイゼーション
- シグナル検出および数量化
- シグナル検出の失敗例とその対処法
◆ Real-time PCRによる遺伝子発現量比較
- 原理
- 操作手順
- プロトコール
◆ インベーダー法による一塩基多型（SNP）タイピング法
- ハイスループットSNPタイピングについて
- Multiplex PCR法を用いた鋳型の準備
- 鋳型であるPCR産物のカードへの分注
- インベーダー試薬の注入
- タイピングカードのシーリング
- インベーダー反応
- ジェノタイプの決定
◆ TaqMan-PCR法による一塩基多型（SNP）タイピング法
- 原理
- 操作手順
- プロトコール
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（2021年8月23日）
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