フローチャート方式で疾患遺伝子同定までの研究の流れが一目瞭然.また,ソフトの選び方やインストールの仕方からその使用方法,解析理論までわかりやすく解説.遺伝学や統計学の基礎も学べる,ゲノム医学と統計学を結ぶ入門書.
目次
総論:遺伝統計学の重要性【鎌谷直之】
第1章:次々に発見される多因子性・単一性疾患の遺伝子〜遺伝統計学の威力〜
1)パラメトリック連鎖解析によるFJHN遺伝子領域の同定【森谷眞紀/工藤英治/手塚 理/鎌谷直之/板倉光夫】
2)ノンパラメトリック連鎖解析による糖尿病遺伝子領域の同定【岩崎直子】
3)ゲノムワイド相関解析による乾癬感受性遺伝子の検索【岡本浩一/田宮 元/猪子英俊】
4)SNPを用いたゲノムワイドcase-control相関解析による慢性関節リウマチ関連遺伝子の解析【山田 亮】
5)遺伝統計学的研究計画の立案と事前評価【斎藤 聡】
第2章:パソコン使えばこんなにかんたん!〜遺伝統計学ソフトの選択と使い方〜
1)ソフトウェアの選択、入手およびインストール方法【斎藤仁之】
2)入力ファイル作成の実際【斎藤 聡】
3)Linkage packageの使用法【斎藤仁之】
4)Genehunterの使い方【久野慎一】
5)Mapmaker/sibsの使い方【冨田 誠/鎌谷直之】
6)家系矛盾検出ソフトウェアCheckfamの原理と使い方【斎藤仁之】
7)その他のソフトウェアの使い方【鎌谷直之】
第3章:落とし穴にはまらないための遺伝統計学理論
1)パラメトリック連鎖解析の理論【斎藤仁之】
2)ノンパラメトリック連鎖解析の理論【斎藤仁之】
3)連鎖不平衡解析の理論【北村 豊】
4)TDTの理論【元木光雄/鎌谷直之】
5)case-control studyの理論【大橋 順】
6)家系データと集団データの解析の理論【鎌谷直之】
第4章:あなたの遺伝学の知識、正しいですか?【鎌谷直之】
1)メンデルの法則とその正しい解釈
2)連鎖に関するさまざまな知識
3)ハプロタイプと連鎖不平衡の知識
4)集団遺伝学の知識
第5章:これだけは知っておきたい統計学の基礎【間瀬 茂】
1)確率と尤度
2)ベイズ統計と事後分布
3)モンテカルロシミュレーションとその応用
4)EMアルゴリズム
付録
用語解説【鎌谷直之】
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- 【本書名】これならわかる! データを活かす! ポストゲノム時代の遺伝統計学〜実例から学ぶ疾患遺伝子同定の近道
- 【出版社名】羊土社
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(2021年8月23日)
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