改訂　バイオ実験の進めかた

1章　cDNAを手に入れる
A　遺伝子の塩基配列がわかる場合のcDNAの入手法
　　A-1.cDNAライブラリーからcDNAを手に入れる
　　A-2.PCRによってcDNAを手に入れる
　　A-3.平均化cDNAライブラリー作製
　　A-4.人から手に入れる
B　遺伝子の塩基配列がわからない場合のcDNAの入手法
　　B-1.精製タンパク質のアミノ酸配列から合成したオリゴヌクレオチドによる
　　　　　　cDNAライブラリーのスクリーニング
　　B-2.mRNAの発現量の差をもとにcDNAを手に入れる
　　B-3.cDNAの発現クローニング
2章　タンパク質の精製，抗体の取得とアミノ酸配列決定
A　タンパク質の精製と抗体の取得
　　A-1.細胞からタンパク質を手に入れる
　　A-2.抗体を取得する
B　アミノ酸配列を決定する
　　B-1.アミノ酸配列分析用タンパク質の調製
　　B-2.アミノ酸配列（一次構造）決定
3章　遺伝子の構造解析
A　cDNAの塩基配列を決定する（シークエンス）
　　A-1.アイソトープによる標識法
　　A-2.蛍光シークエンサー（非アイソトープによる標識）
B　データベースを用いた遺伝子の構造解析と機能予測
　　B-1.ホモロジー検索による機能予測
　　B-２.立体構造の予測
4章　タンパク質の精製，抗体の取得とアミノ酸配列決定
A　タンパク質の活性測定
　　A-1.タンパク質の生産
　　A-2.生化学的活性を知る
B　タンパク質の局在性の検定を行う
　　B-1.免疫染色法（免疫組織化学染色法）
　　B-2.免疫電顕法
　　B-3.GFPを利用した局在性検定
C　タンパク質-タンパク質の相互作用を調べる
　　C-1.融合タンパク質を用いて目的のタンパク質の検出を行う
　　C-2.抗体を用いて目的のタンパク質の検出を行う
　　C-3.表面プラズモン共鳴法
D　DNA-タンパク質の相互作用を調べる
　　D-1.DNA結合因子の解析法
　　D-2.DNA非結合因子の解析法
E　タンパク質の修飾を解析する
　　E-1.リン酸化の解析
　　E-2.タンパク質に付加した複合糖鎖の解析
5章　遺伝子の発現解析
A　目的のmRNAの発現している組織，細胞，量それに時期，期間を知る
　　A-1.cDNAセットの購入
　　A-2.mRNAフィルター，ポリA mRNAアレイの購入
　　A-3.mRNAの抽出方法
　　A-4.発現情報解析の方法
B　目的のmRNAの発現調節機構を調べる
　　B-1.発現はどのレベルで調節されているのかを知る
　　B-2.発現調節領域の同定
　　B-3.転写後の調節機構を知る
　　B-4.エピジェネティクスによる遺伝子発現調節
C　転写制御因子を解析する
　　C-1.転写因子の解析
　　C-2.転写因子の精製
　　C-3.目的遺伝子と転写因子の相互作用
6章　細胞・生体レベルの遺伝子機能解析
A　培養細胞への遺伝子導入と発現
　　A-1.人工変異の導入方法
　　A-2.発現ベクターのデザイン
　　A-3.培養細胞への遺伝子導入の方法論
　　A-4.遺伝子組み込み細胞株の樹立
　　A-5.レポーター遺伝子導入と発現アッセイ法
B　アンチセンスオリゴヌクレオチドの導入による遺伝子の機能解析
　　B-1.アンチセンスオリゴヌクレオチドのデザインと全体のプロトコール
　　B-2.培養細胞へのアンチセンスオリゴヌクレオチドの導入
C　動物個体への遺伝子導入BR>　　C-1.トランスジェニック
　　C-2.ノックアウト
　　C-3.生体への全身あるいは局所的遺伝子導入法
D　動物個体の大量変異株のバンク状況と取得のための利用法
7章　幹細胞（ES細胞）を用いた実験法
A　ES細胞の樹立と培養，保存などの基礎技術
　　A-1.ES細胞の取り扱い
　　A-2.フィーダー細胞の注意
　　A-3.ES細胞への遺伝子導入
B　ES細胞の分化誘導系を用いた遺伝子機能解析の戦略
　　B-1.ES細胞のin vitro 分化誘導
　　B-2.ES細胞のin vivo 分化誘導
8章　ゲノム研究時代の網羅的遺伝子研究
A　癌を含む疾患原因遺伝子の分離・同定
　　A-1.ポジショナルクローニングによる遺伝性疾患の原因遺伝子の同定
　　A-2.ポジショナルクローニングによる非遺伝性の癌の原因遺伝子の同定
　　A-3.候補遺伝子の同定
　　A-4.遺伝子変異の同定
B　SNPsによるcommon diseaseのリスク評価
　　B-1.SNPsデータベース
　　B-2.SNPsを利用した疾患関連遺伝子の同定法
C　包括的ゲノム機能解析
　　C-1. トランスクリプトーム関連技術
　　C-2.プロテオーム関連技術
D　バイオインフォマティクス
　　D-1.ゲノム