プロテオーム解析法

第1章　総論
１ ゲノムサイエンスの推進とプロテオーム・プロテオミクス研究の役割
２ プロテオーム研究の全体像
　
第2章　タンパク質プロファイリング技術
I．プロファイリング技術の現状と展望
II．二次元電気泳動法によるプロファイリング
１ プロテオームマップ作成法
２ プロテオームマップのデータ取り込み／画像解析法(1)
３ プロテオームマップのデータ取り込み／画像解析法(2)
４ 特異的検出法を用いたプロファイリング
　　a）各種の特異的検出法
　　b）リン酸化タンパク質の検出
III．多次元クロマトグラフィー法によるプロファイリング
１ 二次元クロマトグラフィー法によるプロファイリング（マニュアル法）
２ 二次元クロマトグラフィー法によるプロファイリング（自動化法）
IV．同位体ラベル法によるプロテオーム変動解析
　
第3章　プロテオミクスのためのタンパク質同定法
I．タンパク質同定技術の現状と展望
II．質量分析による同定法
１ MS/MSスペクトルに含まれる 部分配列情報を利用した同定法（質量タグ法）
２ de novo sequencingのための解析ソフトウェア
３ 翻訳後修飾の同定法
III．逐次分解による同定法
１ エドマン分解法による同定
２ C-末端解析による同定
　
第4章　タンパク質相互作用リンケージ解析法
I．総括的タンパク質間相互作用解析法の現状と展望
II．アフィニティーキャプチャーを利用した相互作用解析法
１ エピトープ・タグを用いたグループ特異的沈降法による相互作用解析法
２ リン酸化ペプチドを用いた解析
III．カラムスイッチング技術を利用した相互作用解析法
IV．BIA-MSによる相互作用解析法
V．バイオインフォマティクスによる相互作用解析
１ 構造生物学からのアプローチ
２ 構造ゲノム学からのアプローチ
　
第5章　プロテオームデータベース
１ プロテオームデータベースの現状と課題
２ プロテオームデータベース作成法
　
第6章　生命科学研究への応用
I．ゲノム解析完了微生物と高等植物へのプロテオーム解析の適用
１ 枯草菌のプロテオーム解析
２ ラン藻のプロテオーム解析
３ 線虫のプロテオーム解析
４ 植物のプロテオーム解析
II．プロテオミクスを用いた細胞内情報解析と医学・薬学への応用
１ 発生過程のプロテオーム解析
２ 小脳形成期のプロテオーム解析
３ アルツハイマー病のプロテオーム解析
４ 細胞老化 および 不死化 における研究
５ 創薬の戦略としてのプロテオーム解析
　　a）サロゲートの同定から薬理プロテオミクスまで
　　b）細胞膜タンパク質のプロテオーム解析
　
第7章　プロテオーム解析技術の将来
１ 自動化とマイクロフルイディクス