病原体由来DNAのセンサーであるTLR9は,哺乳類に比べて細菌やウイルスに多くみられる配列に強く応答する.特にシトシンとグアニンがホスホジエステル結合でつながった配列 (CpG) は,哺乳類ではメチル化されていることが多いが,細菌やウイルスではメチル化されていないことが多く,メチル化されていないCpGが強くTLR9を刺激する.