TrxGによりメチル化されるH3K4me3は遺伝子の活性化の,PcGによりメチル化されるH3K27me3は不活化の修飾として知られる.ES細胞では,分化関連遺伝子はH3K4me3とH3K27me3修飾がプロモーター上に共存するbivalentな修飾状態にある.発生・分化の過程で,遺伝子ごとにH3K4me3/H3K27me3のどちらかの修飾に決定され発現が調節される.