OTU

OTU（operational taxonomic unit）．細菌の必須遺伝子（一般に，16SリボソームRNA遺伝子）の塩基配列をコンピュータ上でその類似度を指標に分類したときに得られる単位をいう．細菌叢からの16S遺伝子配列データをある類似度（例えば，97%）閾値でOTU解析すると，その閾値以上の類似度をもつ16S遺伝子配列群からなる多数のOTUが形成される．つまり，類似度97%の場合，各OTUは進化的に同一の菌種から構成される．ただし，細菌学における分類とは厳密には一致しないOTUも存在する．

実験医学増刊 Vol.30 No.20