テストDNAとコントロールDNAをそれぞれ異なる色素で標識した後に,DNAアレイ上に固定化されたコントロールDNA断片に対してテストDNAをハイブリダイズし,蛍光強度を比較することでテストDNAに生じている増幅・欠失などの量的な変化を検出する方法.