ゲノムアセンブリの文脈では,ゲノム配列中に2回以上出現する配列のことを指す.配列の内容は重複遺伝子であってもレトロトランスポゾンであっても何でも構わない.一般的な生物学の文脈では自己複製して増殖する配列を指して反復配列とよぶことが多いがそれとは意味が異なる.