オリゴヌクレオチドが結合した2分子間の距離が近接したとき,これらのオリゴヌクレオチドがハイブリダイズすることで,核酸合成・伸長反応が起こる.この増幅された核酸を標識することで,分子間相互作用を検出する.標的分子として抗体を用いることで,細胞内での基質のリン酸化を定量解析できる.