腸内微生物叢に限らず,排水・廃棄物処理系汚泥等の嫌気環境下で,微生物群は多糖類やタンパク質の加水分解菌が他の微生物が吸収しやすい低分子化合物に分解し,酸生成菌が有機酸にまで代謝し,これらを古細菌がCH4, CO2, H2等のガスとして排出する.