ChIP-seq法

クロマチン免疫沈降法 (chromatin immunoprecipitation: ChIP) と次世代シークエンサーを組合わせた新技術．免疫沈降で回収したDNA断片に，機種に応じたサンプル調整を施し，超高速シークエンシングを行う．ヒストンメチル化などクロマチン構造変化のエピジェネティックな修飾や転写調節因子（DNA結合タンパク質）のゲノム上での結合部位を，ゲノムワイドかつ網羅的に解析することができる．マイクロアレイを利用した従来のChIP-on-chip法と比べ，１回のランで全ゲノムを対象とした膨大な量の解析が行えるため効率がよく，さらに感度，解像度ともに優れている．

国際エピゲノムプロジェクト等で，大規模にさまざまな動物種，細胞で標準情報が取得されており，また，研究者自体の解析データも公開が義務付けられている場合が多く，外部に開かれたデータ解析でもある．

参考書籍

• 実験医学 2009年1月号 Vol.27 No.1 特集「超高速シークエンスが開く次世代の生命科学」
• 実験医学増刊 Vol.28 No.17 特集「血管研究と血管治療」
• 実験医学 2014年8月号 Vol.32 No.13 特集「エピゲノムの本質はヒストンバリアントにあった！」